La colección de tejidos de la CPUM es una colección accesoria constituida por más de 70,000 tejidos, musculares o de aletas, tomados de individuos pertenecientes a aproximadamente 1,500 especies de peces. La mayoría de los tejidos cuentan con organismos de referencia resguardados en la CPUM. La colección de tejidos es de gran utilidad para estudios de sistemática y biogeografía, y para las investigaciones sobre la variación genética, endogamia y flujo génico. Es imprescindible para los estudios de paternidad y en la conservación biológica, e incluso para el descubrimiento de nuevas especies, por lo que la colección de tejidos es una herramienta complementaria de gran valor en el trabajo ictiológico de la CPUM.