La Colección de Peces de la Universidad Michoacana (CPUM, SEMARNAT Clave: MICH.-PEC-227-07-09) consta de 14,104 lotes con 146,780 organismos colectados desde 1976. Su objetivo es preservar organismos para la investigación en taxonomía, anatomía, biogeografía, ecología, conservación, biología molecular y apoyar
actividades de divulgación y docencia.

La colección de tejidos de la CPUM es una colección accesoria constituida por más de 70,000 tejidos, musculares o de aletas, tomados de individuos pertenecientes a aproximadamente 1,500 especies de peces. La colección de tejidos es de gran utilidad para estudios de sistemática y biogeografía, y para las investigaciones sobre la variación genética, endogamia y flujo génico.

Desde el año 2007 los miembros y colaboradores del Laboratorio de Biología Acuática "J. Javier Alvarado Díaz" han documentado fotográficamente el trabajo realizado en diversas partes del mundo, los resultados de dicha documentación son presentados en la Colección Fotográfica de la Universidad Michoacana con más de 8,000 fotografías con escala que pueden ser utilizadas para trabajos taxonómicos.